第一組
1.各項傳染病防治
2.預防接種與指導
3.優生保健（含婦幼健康與兒童保健）
4.中老人病防治
5.癌症防治（含肺癌、口腔、大腸、子宮頸及乳癌等癌症篩檢）
6.慢性病代謝症候防治
7.健康促進
8.長期照護
9.社區心理衛生
10.老人假牙、菸害防制戒菸服務及衛教宣導
第二組
☆藥政業務
1.藥商、藥局設立、變更及停歇業登記事項等業務及普查與輔導
2.藥商（含中藥商）、藥局藥事人員執業、變更與停歇業登記事項業務管理及稽 查與輔導
3.實施醫藥分業-藥局、西藥販賣藥事人員執業情形
4.機構（醫院、診所、藥局、動物醫院、藥商販賣業、藥商製造業）申請管制藥品登記證停、歇業及變更業務
5.管制藥品銷毀、減損業務及輔導查核
6.用藥安全、藥物濫用宣導
7.藥品化粧品醫療器材之不法查緝及違規案件與廣告之移送查處（含人民陳情申訴檢驗案件）
☆醫政業務
1.各類醫事機構開業、歇業及變更管理及稽查與輔導
2.各類醫事人員執（歇）業、異動管理
3.各類醫事人員報備支援審核
4.密醫及醫事人員非法執業查辦及陳情案件
5.辦理醫事機構及人員卡（RAO系統）
6.勞工健檢業務
7.救護車管理、民防
8.緊急災害應變及CPR教育訓練
☆食品業務
1.食品製造業、販賣業餐飲場所之衛生管理及稽查輔導
2.疑似食物中毒案件調查採證等處理
3.食品衛生安全及國民營養宣導
4.食品違規廣告監錄及違規食品案件調查（含人民陳情申訴檢驗案件）
5.市售食品標示稽查
6.加水站業務
☆營業衛生業務
1.營業衛生類別事業單位管理稽查與輔導
2.營業衛生例行採樣送驗
3.輔導營業衛生自主管理與衛生管理人衛生講習
☆菸害稽查業務
1.各類別事業單位及各級學校菸害稽查與輔導
2.菸害防制陳情案件調查處理
☆行政相驗與死因統計
總務室
總務、文書管理、檔案管理、資訊管理、財產管理