清乾隆元年，一批住在屏東武洛庄的客家人，因環境欠佳，孤立於閩南人的聚落包圍中，加上閩客之間的對立，深感無發展的遠景，因此在林豐山兄弟領導下，越過荖濃溪往北到靈山下平原處開墾，乃因該地以水為源，汲用不絕，而取『瀰』，居民皆務農而取濃，故名『瀰濃庄』。後因1920年日本人在台實施地方制度，台灣很多地名都被改名日本地名，【瀰濃】客話音與日本美濃國【mino、在今歧埠縣】同音所致因而將『瀰濃』改為『美濃』，沿用至今。
美濃移墾立庄，迄今己二百六十多年【西元一七三六年】，人口從墾拓時的四十多人至現在的五萬多人，在這一塊安靜、祥和、水草豐美的土地上，一群儉樸、勤奮的人們創立了很有特色的文化，他們遵守優良傳統，尊天敬袓，不尚奢華，注重教育、祟尚道德，如今成為保存客家文化最完整的地方。
美濃衛生所於民國三十九年三月成立，為鎮公所附屬單位，所址設在鎮圖書館，獲農發會及美國援華公署，補助大批藥械，開始辦理門診醫療業務。
民國四十一年七月，依據衛生所組織規程改隸屬為高雄縣衛生局。
民國四十五年一月，獲農復會補助，在本區合和里美濃橋旁興建新辦公廳，同年十一月完工，遷入新址辦公。
民國四十六年鎮衛生所改隸屬鎮公所。
民國六十二年依據修正鄉鎮衛生所組織規程，再次改隸屬高雄縣衛生局。
民國七十一年二月，獲行政院衛生署補助，興建廣林衛生室，址位於廣林里廣九街９號。
民國七十四年四月獲行政院衛生署補助，興建吉洋衛生室，址位於吉東里和興街１３號。
民國七十七年吉洋、廣林兩衛生室改稱為『吉洋、廣林、基層保建服務中心』積極推動兩里衛生保建工作。
民國七十八年本所辦公廳建築三十三年，已狹窄不敷使用，決定擇地改建唯用地不昜取得，而暫時遷移至鎮體育館辦公。
民國八十年四月一日成立群體醫療中心。
民國八十二年經向縣府爭取撥用美濃段2454-3號一六五0平方公尺土地使用權。衛生處於八十三年會計編列補助款重建衛生所辦公房舍經費，並於八十五年落成啟用。
民國九十九年十二月二十五日高雄縣、市合併，更名為高雄市美濃區衛生所